L'ozono e i suoi prodotti secondari (come l'idrossile) hanno il più potente effetto battericida e virucida, possono essere utili per prevenire la diffusione di malattie infettive,
Gli esperimenti mostrano che le stesse concentrazioni di ozono uccidono batteri e virus sono 600-3000 volte il cloro.
Quando la concentrazione di ozono è di 1 mg / L, l'inattivazione di coli fecali richiede solo 5 secondi, con le stesse concentrazioni di cloro per ottenere lo stesso effetto di 15.000 secondi.
L'ozono è un fungicida verde ecologico riconosciuto a livello internazionale che non provoca alcun inquinamento ambientale secondario, il cloro reagisce con la materia organica presente nell'acqua formando vari composti organici clorurati come il cloroformio e il triclorometano, queste sostanze sono riconosciute come mutageni cancerogeni. Quando le persone nuotano, queste sostanze tossiche vengono assorbite dal corpo (il corpo nell'acqua può assorbire 500 ml di acqua all'ora).
I composti organici clorurati nell'acqua stimolano anche gli occhi e la pelle, causando arrossamenti e arrossamenti della pelle.